fix:the models run even if there are holes in the soil temperature data series

src/main/java/no/bioforsk/vips/model/roughagenutritionmodel/RoughageNutritionModelImpl.java

@@ -1351,6 +1351,7 @@ public class RoughageNutritionModelImpl implements CostFunction {
         WeatherObservation eldsteDoegnverdi;
         WeatherObservation forrigeDoegnverdi = null;
         Calendar cal = Calendar.getInstance(this.timeZone);
+
         // Må ha minst sju jordtemperaturverdier
         Iterator<WeatherObservation> ji = (jordTemperatur != null && jordTemperatur.size() >= 7) ? jordTemperatur.iterator() : null;
         for (Iterator<WeatherObservation> i = dognMiddelLuftTemperatur.iterator(); i.hasNext();) {
@@ -1568,6 +1569,7 @@ public class RoughageNutritionModelImpl implements CostFunction {
             }
 
             Date forrigeDato = null;
+            int hulljordTemp = 0;
             boolean first = true;
             int counter = 0;
             Calendar cal = Calendar.getInstance(this.timeZone);
@@ -1578,7 +1580,7 @@ public class RoughageNutritionModelImpl implements CostFunction {
                 WeatherObservation potFord = potFordI.next();
                 WeatherObservation straaling = straalingI.next();
                 WeatherObservation jordTemperatur = (jordTempI != null && jordTempI.hasNext()) ? jordTempI.next() : null;
-
+               
                 Date dagensDato = luftTemperatur.getTimeMeasured();
 
                 if (first) {
@@ -1601,14 +1603,19 @@ public class RoughageNutritionModelImpl implements CostFunction {
                             + "<ul><li>Temperaturlinjas dato er " + dagensDato.toString() + "</li><li>Nedb&oslash;rlinjas dato er " + nedboer.getTimeMeasured().toString()
                             + "</li><li>Potensiell fordampinglinjas dato er  " + potFord.getTimeMeasured().toString() + "</li><li>Globalstr&aring;lingslinjas dato er " + straaling.getTimeMeasured().toString() + "</li></ul>");
                 }
-
-                if (jordTemperatur != null && dagensDato.compareTo(jordTemperatur.getTimeMeasured()) != 0) {
-                    throw new ModelExcecutionException("Feil ved klimadata: Jordemperatur har hull i datasettet, omkring dato " + dagensDato);
+                
+                if (jordTemperatur != null && dagensDato.compareTo(jordTemperatur.getTimeMeasured()) == 0) {
+                    hulljordTemp = counter;
+                    //throw new ModelExcecutionException("Feil ved klimadata: Jordemperatur har hull i datasettet, omkring dato " + dagensDato);
                 }
 
                 forrigeDato = dagensDato;
                 counter++;
             }
+            
+            // jordTemperatur holder bare verdier frem til et evt hull i serien. Serien kan derfor være kortere enn seriene for temperatur, nedbør, fordamping og stråling
+            this.jordTemperaturVerdier = this.jordTemperaturVerdier.subList(0, hulljordTemp);
+
             sisteDato = forrigeDato;
             if (counter < 10 || foersteDato == null || sisteDato == null) {
                 throw new ModelExcecutionException("Feil ved klimadata: For få klimadata.");