Weather parameter refactoring

src/main/java/no/nibio/vips/model/naerstadmodel/NaerstadModel.java

@@ -286,7 +286,7 @@ public class NaerstadModel extends I18nImpl implements Model{
                     this.TM.add(o); break;
                 case WeatherElements.PRECIPITATION:
                     this.RR.add(o); break;
-                case WeatherElements.LEAF_WETNESS:
+                case WeatherElements.LEAF_WETNESS_DURATION:
                     this.BT.add(o); break;
                 case WeatherElements.GLOBAL_RADIATION:
                     this.Q0.add(o); break;

src/main/resources/no/nibio/vips/model/naerstadmodel/texts_nb.properties

@@ -18,4 +18,4 @@
 name=N\u00e6rstads modell
 usage=F\u00f8lgende input kreves:\nobservations - array (liste) over m\u00e5ledata. En observasjon best\u00e5r av:\n\ttimeMeasured - m\u00e5leverdiens tidsstempel\n\telementMeasurementTypeId - kode for m\u00e5leparameter\n\tlogIntervalId: 1 for timeverdi\n\tvalue: verdien p\u00e5 den m\u00e5lte parameteren\nFire forskjellige m\u00e5leparametre m\u00e5 sendes inn:\n* TM - Middeltemperatur (Celcius)\n* RR - Aggrebert nedb\u00f8r (Millimeter)\n* Q0 - Globalstr\u00e5ling (Wh/m2)\n* BT - Bladfukt (antall minutter/time)\nDisse m\u00e5 alle v\u00e6re timedata. De m\u00e5 alle v\u00e6re komplette tidsserier i eksakt samme periode.\nMinimum lengde p\u00e5 tidsserie: 4 dager.\n\nF\u00f8lgende input er valgfritt:\n\ncalculationStart - tidspunktet fra n\u00e5r beregningen skal starte\ncalculationEnd - hvor langt fram i tid beregningen skal g\u00e5
 description=<p>Modellen er laget av forsker Ragnhild N&aelig;rstad, p&aring; grunnlag av resultater fra forskingsprosjektet NORPHYT. Modellen beregner risiko for sporeproduksjon med p&aring;f&oslash;lgende spredning, overlevelse og infeksjon p&aring; grunnlag av v&aelig;rdata. For at infeksjonen virkelig skal skje m&aring; det v&aelig;re smitte til stede.</p>\n<p>Modellen er basert p&aring; fors&oslash;k over flere &aring;r hvor testplanter av potet, dyrket i veksthus, har blitt eksponert et d&oslash;gn for smitte fra et potetfelt med t&oslash;rr&aring;te p&aring; friland. T&oslash;rr&aring;teangrepet p&aring; disse testplantene har blitt sammenholdt med v&aelig;rforholdene dagen de ble eksponert, og basert p&aring; dette er det laget en modell. Modellen beregner hvor gunstig v&aelig;ret er for sporeproduksjon med p&aring;f&oslash;lgende sporespredning, overlevelse og infeksjon av sporene. Modellen er laget slik at risikotallene &oslash;ker med angrepet i testplantene. Terskelverdien p&aring; 2,5 som gj&oslash;r at varslet blir r&oslash;dt, tilsvarer at det i gjennomsnitt ble funnet en t&oslash;rr&aring;teflekk per testplante. H&oslash;ye verdier betyr at v&aelig;rforholdene gir stor risiko for infeksjon hvis det er smitte til stede.</p>\n<h3>Data</h3>\n<ul>\n<li>Modellen bruker f&oslash;lgende parametere som timeverdier:</li>\n<li>Lufttemperatur i 2m h&oslash;gde(TM)</li>\n<li>Relativ luftfuktighet i 2m h&oslash;gde(UM)</li>\n<li>Nedb&oslash;r, mm (RR)</li>\n<li>Vind i 2m h&oslash;gde(FM2)</li>\n<li>Vind i 10m h&oslash;gde(FF)</li>\n<li>Netto str&aring;ling, Wh/m2</li>\n<li>Kortb&oslash;lget globalstr&aring;ling, Wh/m2 (Q0)</li>\n<li>Bladfuktighet i 2m h&oslash;gde, minutter/t (BT)</li>\n<li>Metningstrykk=0.61078*EKSP(17.269* TM /(TM +237.3)), kP</li>\n</ul>\n<h3>Sporeproduksjon</h3>\n<p>Det m&aring; v&aelig;re fuktig, med metningsdeficit under 220 Pa (over ca 90 % luftfuktighet), i minimum 87 timegrader for &aring; sette i gang sporeproduksjonen. Jo lenger fuktperioden er jo mer sporer blir produsert. Ved metningsdeficit mellom 220 og 520 Pa reduseres sporeproduksjonen, og ved metningsdeficit over 520 Pa stopper den. Ved dette vanndamptrykket t&oslash;rker sporeb&aelig;rerne inn.</p>\n<h3>Sporespredning og sporeoverlevelse</h3>\n<p>Sporene spres ut i luften n&aring;r luftfuktigheten synker. Fritt vann p&aring; bladene hemmer sporespredning til luft. Regn vasker ned en del av sporene. Ved sterkt sollys d&oslash;r en stor andel av de frigitte sporene. En time med sterkt sollys dreper ca 95 % av de eksponerte sporene.</p>\n<h3>Risiko for t&oslash;rr&aring;te</h3>\n<p>Sporene trenger fritt vann for &aring; spire, enten fra nedb&oslash;r eller dugg. Det m&aring; v&aelig;re v&aring;tt p&aring; bladene i minimum 40 timegrader for at sporene skal rekke og b&aring;de spire og infisere. Jo lenger den v&aring;te perioden er jo h&oslash;yere andel av sporene rekker &aring; infisere.</p>\n<p>Risiko for t&oslash;rr&aring;te beregnes slik: <br />Risiko= (TSWH(t) /40)*VRS(t) *IR(t)<br />TSWH(t) =temperatursum for timer med bladfukt<br />VRS(t) =tilgjengelige sporer som er spredt<br />IR(t) = Infeksjonsrisiko</p>\n<h3>Tolking av varsel</h3>\n<h4>F&oslash;rste spr&oslash;yting</h4>\n<p>Det er normalt ikke n&oslash;dvendig med t&oslash;rr&aring;tespr&oslash;yting f&oslash;r radlukking. Ved langvarig t&oslash;rr&aring;tev&aelig;r kan det i omr&aring;der med tidligpotetdyrking og/eller i &aring;r med mye prim&aelig;rsmitte v&aelig;re n&oslash;dvendig &aring; behandle f&oslash;r dette tidspunkt. Dersom de akkumulerte risikoverdiene i negativprognosemodellen n&aring;r 150 tidligere, b&oslash;r en starte spr&oslash;ytingen ved f&oslash;rste varsel etter "N&aelig;rstadmodellen" eller "F&oslash;rsunds modell" etter dette tidspunktet.</p>\n<p>I &aring;r med lange perioder med v&aring;t jord i juni har det v&aelig;rt funn av t&oslash;rr&aring;te tidligere enn det Negativprognosemodellen tilsier. Sammenhold av tidspunktet for tidlige t&oslash;rr&aring;tefunn i Norge de ti siste &aring;rene (2003-2012), og t&oslash;rr&aring;terisikoen m&aring;lt med N&aelig;rstad modellen, viser at det ikke har blitt funnet t&oslash;rr&aring;te (i felt uten dekking) f&oslash;r det har v&aelig;rt minst to perioder med h&oslash;y t&oslash;rr&aring;terisiko (dager med flere timer med t&oslash;rr&aring;terisiko over 10) i kombinasjon med v&aring;t jord (to uker med vannmetning). Basert p&aring; dette blir tilr&aring;dningen n&aring; &aring; begynne t&oslash;rr&aring;tespr&oslash;ytingen i felter med v&aring;t jord dagen f&oslash;r den andre perioden med h&oslash;ye t&oslash;rr&aring;terisikoverdier fra N&aelig;rstad modellen etter spiring.</p>\n<h4>P&aring;f&oslash;lgende spr&oslash;yting</h4>\n<p>Ved varsel om fare for t&oslash;rr&aring;teinfeksjoner (N&aelig;rstadmodellen eller F&oslash;rsunds modell), b&oslash;r spr&oslash;yting vurderes ut fra den aktuelle sortens mottakelighet, middelvalg og tidspunkt for forrige behandling. Det er st&oslash;rst fare for infeksjon n&aring;r det varsles to eller flere dager etter hverandre, og n&aring;r t&oslash;rr&aring;te er observert i omr&aring;det.</p>\n<p>T&oslash;rr&aring;temidlene har best effekt hvis de brukes forebyggende. Infeksjon skjer normalt i morgentimene. Det betyr at det b&oslash;r spr&oslash;ytes i dag hvis det er varslet fare for t&oslash;rr&aring;teinfeksjon i morgen, n&aring;r potetene har liten beskyttelse igjen etter siste spr&oslash;yting. Spr&oslash;yting gir beskyttelse i 7 til 14 dager avhengig av middel og dose og vekstforhold. Det er bare under ekstreme forhold med kraftig risvekst og h&oslash;y t&oslash;rr&aring;terisko hver dag eller bruk av lave doser (10 - 50% av normal dose), det er behov for &aring; spr&oslash;yte oftere enn hver 7. dag.</p>\n<h3>&nbsp;</h3>\n<h3>Varslingssesong &ndash; oppstart og avslutning av varsel</h3>\n<p>Starttidspunkt: 15/5<br />Sluttidspunkt: 15/9</p>\n<h3>Utpr&oslash;ving og validering av modellen</h3>\n<p>N&aelig;rstads modell har blitt validert i Norge de siste &aring;rene, og forventes publisert i l&oslash;pet av 2017.</p>\n<p>Kontaktperson:&nbsp;<a href="http://www.nibio.no/ansatte/haavard_eikemo" target="_blank">H&aring;vard Eikemo</a></p>\n<p>Lenker til mer informasjon<br /><a href="http://leksikon.nibio.no/vieworganism.php?organismId=1_281&amp;showMacroOrganisms=false" target="_blank">http://leksikon.nibio.no/vieworganism.php?organismId=1_281&amp;showMacroOrganisms=false</a></p>
-statusInterpretation=<ul>\n<li>N\u00e5r Risiko < 1 settes varselsymbolet til gr\u00f8nt</li>\n<li>N\u00e5r Risiko er mellom 1 - 2,5 settes varselsymbolet til gult</li>\n<li>N\u00e5r Risiko > 2,5 settes varselsymbolet til r\u00f8dt</li>\n</ul>\n<p>\nVed varsel om fare for t\u00f8rr\u00e5teinfeksjoner (N\u00e6rstadmodellen eller F\u00f8rsunds modell), b\u00f8r spr\u00f8yting vurderes ut fra den aktuelle sortens mottakelighet, middelvalg og tidspunkt for forrige behandling. Det er st\u00f8rst fare for infeksjon n\u00e5r det varsles to eller flere dager etter hverandre, og n\u00e5r t\u00f8rr\u00e5te er observert i omr\u00e5det.</p>\n<p>T\u00f8rr\u00e5temidlene har best effekt hvis de brukes forebyggende. Infeksjon skjer normalt i morgentimene. Det betyr at det b\u00f8r spr\u00f8ytes i dag hvis det er varslet fare for t\u00f8rr\u00e5teinfeksjon i morgen, n\u00e5r potetene har liten beskyttelse igjen etter siste spr\u00f8yting. Spr\u00f8yting gir beskyttelse i 7 til 14 dager avhengig av middel og dose og vekstforhold. Det er bare under ekstreme forhold med kraftig risvekst og h\u00f8y t\u00f8rr\u00e5terisiko hver dag eller bruk av lave doser (10 - 50% av normal dose), det er behov for \u00e5 spr\u00f8yte oftere enn hver 7. dag.</p>
+statusInterpretation=<ul>\n<li>N\u00e5r Risiko < 1 settes varselsymbolet til gr\u00f8nt</li>\n<li>N\u00e5r Risiko er mellom 1 - 2,5 settes varselsymbolet til gult</li>\n<li>N\u00e5r Risiko > 2,5 settes varselsymbolet til r\u00f8dt</li>\n</ul>\n<p>\nVed varsel om fare for t\u00f8rr\u00e5teinfeksjoner etter N\u00e6rstadmodellen, b\u00f8r spr\u00f8yting vurderes ut fra den aktuelle sortens mottakelighet, middelvalg og tidspunkt for forrige behandling. Det er st\u00f8rst fare for infeksjon n\u00e5r det varsles to eller flere dager etter hverandre, og n\u00e5r t\u00f8rr\u00e5te er observert i omr\u00e5det.</p>\n<p>T\u00f8rr\u00e5temidlene har best effekt hvis de brukes forebyggende. Infeksjon skjer normalt i morgentimene. Det betyr at det b\u00f8r spr\u00f8ytes i dag hvis det er varslet fare for t\u00f8rr\u00e5teinfeksjon i morgen, n\u00e5r potetene har liten beskyttelse igjen etter siste spr\u00f8yting. Spr\u00f8yting gir beskyttelse i 7 til 14 dager avhengig av middel og dose og vekstforhold. Det er bare under ekstreme forhold med kraftig risvekst og h\u00f8y t\u00f8rr\u00e5terisiko hver dag eller bruk av lave doser (10 - 50% av normal dose), det er behov for \u00e5 spr\u00f8yte oftere enn hver 7. dag.</p>

src/test/java/no/nibio/vips/model/naerstadmodel/NaerstadModelTest.java

@@ -488,7 +488,7 @@ public class NaerstadModelTest extends TestCase {
         {
             switch(o.getElementMeasurementTypeId())
             {
-                case WeatherElements.LEAF_WETNESS:
+                case WeatherElements.LEAF_WETNESS_DURATION:
                     BT.add(o); 
                     break;