From 584f5834ffd5ed8585d58371a00164b76709a746 Mon Sep 17 00:00:00 2001
From: Tor-Einar Skog <tor-einar.skog@bioforsk.no>
Date: Thu, 7 Jan 2016 10:37:08 +0100
Subject: [PATCH] Bugfixes and debug output suppression
---
.../RoughageNutritionModel.java | 11 ++++++++---
.../RoughageNutritionModelImpl.java | 10 ++++------
2 files changed, 12 insertions(+), 9 deletions(-)
diff --git a/src/main/java/no/bioforsk/vips/model/roughagenutritionmodel/RoughageNutritionModel.java b/src/main/java/no/bioforsk/vips/model/roughagenutritionmodel/RoughageNutritionModel.java
index 3c70f82..d83a609 100644
--- a/src/main/java/no/bioforsk/vips/model/roughagenutritionmodel/RoughageNutritionModel.java
+++ b/src/main/java/no/bioforsk/vips/model/roughagenutritionmodel/RoughageNutritionModel.java
@@ -300,6 +300,10 @@ public class RoughageNutritionModel implements Model {
if(config.getConfigParameter("optimizationInfo") != null)
{
List<String> optimizationInfo = mapper.convertValue(config.getConfigParameter("optimizationInfo"), new TypeReference<List<String>>(){});
+ /*for(String inf:optimizationInfo)
+ {
+ System.out.println(inf);
+ }*/
this.optimizationObservations = this.parseOptimizationInfo(optimizationInfo, this.timeZone);
}
@@ -465,14 +469,15 @@ public class RoughageNutritionModel implements Model {
format.parse(parts[0]), // Date
Double.parseDouble(parts[1]), // Height
Double.parseDouble(parts[2]), // MSC
- Double.parseDouble(parts[3]), // FEm
Double.parseDouble(parts[4]), // NDF
Double.parseDouble(parts[5]), // INDF
- Double.parseDouble(parts[6]) // Raw protein
+ Double.parseDouble(parts[6]), // Raw protein
+ Double.parseDouble(parts[3]) // FEm
);
retVal.add(optObs);
}
- catch(ArrayIndexOutOfBoundsException | ParseException ex) {}
+ catch(ArrayIndexOutOfBoundsException | ParseException ex) {
+ }
}
return retVal;
}
diff --git a/src/main/java/no/bioforsk/vips/model/roughagenutritionmodel/RoughageNutritionModelImpl.java b/src/main/java/no/bioforsk/vips/model/roughagenutritionmodel/RoughageNutritionModelImpl.java
index 49d3b00..6a9cf83 100644
--- a/src/main/java/no/bioforsk/vips/model/roughagenutritionmodel/RoughageNutritionModelImpl.java
+++ b/src/main/java/no/bioforsk/vips/model/roughagenutritionmodel/RoughageNutritionModelImpl.java
@@ -885,7 +885,7 @@ public class RoughageNutritionModelImpl implements CostFunction{
if(this.AIBakgrunnsdataMatrise == null)
{
this.beregnAIBakgrunnsdata();
- System.out.println("Resultatmatrise rett etter getMSC" + this.AIBakgrunnsdataMatrise.toString());
+ //System.out.println("Resultatmatrise rett etter getMSC" + this.AIBakgrunnsdataMatrise.toString());
}
//System.out.println("getMSC at" + dato);
return this.AIBakgrunnsdataMatrise.getParamDoubleValueForDate(dato, AIDataMatrix.MSC_BEREGNET);
@@ -1759,7 +1759,7 @@ public class RoughageNutritionModelImpl implements CostFunction{
@Override
public synchronized boolean converged(PointCostPair[] pair) {
- boolean DEBUG = true;
+ boolean DEBUG = false;
// Prøver med 10%
double differencePercentage = 0.1;
double min=0;
@@ -1793,7 +1793,7 @@ public class RoughageNutritionModelImpl implements CostFunction{
if(DEBUG)
System.out.println("[GrovforModell/optimerParametre] DEBUG: alfa=" + optimumUtvikling.getPoint()[0]);
- this.alfa = ((Double) optimumUtvikling.getPoint()[0]).doubleValue();
+ this.alfa = ((Double) optimumUtvikling.getPoint()[0]);
//this.AIbeta = ((Double) optimumUtvikling.getPoint()[1]).doubleValue();
// Nullstiller AI-matrisen, slik at øvrige beregninger går som planlagt
this.AIBakgrunnsdataMatrise = null;
@@ -1802,9 +1802,7 @@ public class RoughageNutritionModelImpl implements CostFunction{
// Sjekker først om vi har observasjoner av avling i peroden før førsteslått og mellom førsteslått og andreslått.
boolean avlingMaaltFoerFoersteslaatt = false;
boolean avlingMaaltMellomFoersteOgAndreslaatt = false;
- for(Iterator<OptimizationObservation> i = this.observasjoner.iterator();i.hasNext();)
- {
- OptimizationObservation observasjon = i.next();
+ for (OptimizationObservation observasjon : this.observasjoner) {
if(observasjon.getDate().before(this.datoFoersteSlaatt) && observasjon.getAvling() > 0)
avlingMaaltFoerFoersteslaatt = true;
if(observasjon.getDate().after(this.datoFoersteSlaatt) && observasjon.getDate().before(this.datoAndreSlaatt) && observasjon.getAvling() > 0)
--
GitLab